Con el objetivo de brindar seguridad a los pasajeros, en la Terminal de Ómnibus de Encarnación se implementa todas las medidas sanitarias. Las personas que llegan al sitio, son objeto de una revisión así como establece el Ministerio de Salud Pública y Bienestar Social.

Los usuarios del transporte público deben justificar su viaje. Es para evitar contratiempos en los controles que se realizan en las rutas del país. Cabe destacar, que las empresas deben desinfectar todos los buses, contar con lavatorios en las oficinas y los encargados deben usar tapabocas para atender a los clientes.
Actualmente las empresas no están operando al 100%, porque existe aún el riesgo de propagación del COVID-19.